| Publicaties | Instituten | Personen | Datasets | Projecten | Kaarten | ||||
PPDB: Plankton-specific protein sequence database
Citeerbaar als data publicatie
Gutierrez, J.; Hablützel, P.I.; Flanders Marine Institute: Belgium; (2022): Plankton-specific protein sequence database. Marine Data Archive. https://doi.org/10.14284/573
Contact:
Hablützel, Pascal ;
Gutierrez, Jayson Beschikbaarheid:
 Deze dataset valt onder een Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationaal-licentie.Beschrijving
Plankton-specific protein sequence database suitable for profiling environmental metagenomic/metatranscriptomic samples meer
Each entry in this fasta file corresponds to a predicted protein sequence for prokaryotic/eukaryotic species. Sequences (2867766) have been taxonomically affiliated (NCBI taxID) and annotated against the UniRef90 database of protein families (clusters). Scope Thema's: Biologie > Plankton Kernwoorden: , Eukaryota, Metagenomics, Plankton, Prokaryotae, Protein sequences, World Oceans Geografische spreiding World Oceans [Marine Regions] Spreiding in de tijd
Vanaf 20 Juli 2022 [Afgelopen] Niet relevant Parameter
Totaal aantal sequenties in de databank Bijdrage door
Vlaams Instituut voor de Zee (VLIZ), meer, data creator
Publicatie
Beschrijft deze dataset
Gutiérrez, J.; Hablützel, P. (2022). A system-level view on the function of natural eukaryotic biomes through taxonomically resolved metabolic pathway profiling. bioRxiv Preprint: 1-23. https://dx.doi.org/10.1101/2022.07.27.501711, meer
Dataset status: Afgelopen
Data type: Data
Data oorsprong: Data collectie
Metadatarecord aangemaakt: 2022-08-02
Informatie laatst gewijzigd: 2022-08-22
| ||||
