VLIZ beheert, onderhoudt en gebruikt mariene onderzoeksinfrastructuur en een marien station, zoals onderzoeksschepen, uitrusting, een duikteam en robotica. De Vlaamse en internationale gemeenschap van mariene onderzoekers kan deze infrastructuur ook gebruiken voor hun eigen onderzoek. In het Marine Station Oostende (MSO) kunnen wetenschappers gebruik maken van gespecialiseerde laboratoria en testlokalen