IMIS

Publicaties | Instituten | Personen | Datasets | Projecten | Kaarten
[ meld een fout in dit record ] Print deze pagina
Oxford Nanopore dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics
Citeerbaar als data publicatie
Doorenspleet, K.; Mailli, A.A.; van der Hoorn, B.; Beentjes, K.; De Backer, A.; Derycke, S.; Murk, A.; Reiss, H.; Nijland, R.; Wageningen University and Research; Nord University; Naturalis Biodiversity Center; ILVO Marine Research; (2024): Oxford Nanopore dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics. Marine Data Archive. https://doi.org/10.14284/683
Contact: Doorenspleet, Karlijn ; Mailli, Amalia
Beschikbaarheid: Creative Commons License Deze dataset valt onder een Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationaal-licentie.
Beschrijving
The Oxford Nanopore metabarcoding dataset for the manuscript: Advancing molecular macrobenthos biodiversity monitoring: a comparison between Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics. meer

For this manuscript 3 datasets are available that all analyze 12 Bulk samples of macrobenthos from the Belgian North Sea. These samples were used: 1. For NovaSeq shotgun metagenomics 2. For Nanopore metabarc oding of amplicons from a COI region 3. For Illumina MiSeq metabarcoding of amplicons from the exact same COI region. This is the data for from the Oxford Nanopore run.
Scope
Thema's:
Biologie > Benthos > Macrobenthos, Biologie > Ecologie - biodiversiteit
Kernwoorden:
Marien/Kust, , DNA, Metabarcoding, Metagenomica, ANE, België
Geografische spreiding
ANE, België [Marine Regions]
Spreiding in de tijd
Oktober 2017
Parameters
Aantallen (geteld)
Soorten
Species richness
Bijdrage door
Wageningen University and Research Centre; Marine Animal Ecology, meer, data creator
Doorenspleet, Karlijn
Murk, Albertinka
Nijland, Reindert
Nord University; Faculty of Biosciences and Aquaculture, meer, data creator
Mailli, Amalia
Reiss, Henning
Naturalis Biodiversity Center (NBC), meer, data creator
Van der Hoorn, Berry
Beentjes, Kevin
Instituut voor Landbouw-, Visserij- en Voedingsonderzoek (ILVO), meer, data creator
De Backer, Annelies
Derycke, Sofie
Gerelateerde datasets
Andere relaties:
Illumina MiSeq dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics, meer
Illumina Novaseq dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics, meer
Dataset status: Afgelopen
Data type: Data
Data oorsprong: Onderzoek: labo-experiment
Metadatarecord aangemaakt: 2024-09-26
Informatie laatst gewijzigd: 2024-09-26
Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid