IMIS

Publicaties | Instituten | Personen | Datasets | Projecten | Kaarten
[ meld een fout in dit record ] Print deze pagina

Oxford Nanopore dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics
Citeerbaar als data publicatie
Doorenspleet, K.; Mailli, A.A.; van der Hoorn, B.; Beentjes, K.; De Backer, A.; Derycke, S.; Murk, A.; Reiss, H.; Nijland, R.; Wageningen University and Research; Nord University; Naturalis Biodiversity Center; ILVO Marine Research; (2024): Oxford Nanopore dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics. Marine Data Archive. https://doi.org/10.14284/683

Beschikbaarheid: Creative Commons License Deze dataset valt onder een Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationaal-licentie.

Beschrijving
The Oxford Nanopore metabarcoding dataset for the manuscript: Advancing molecular macrobenthos biodiversity monitoring: a comparison between Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics. meer

For this manuscript 3 datasets are available that all analyze 12 Bulk samples of macrobenthos from the Belgian North Sea. These samples were used: 1. For NovaSeq shotgun metagenomics 2. For Nanopore metabarc oding of amplicons from a COI region 3. For Illumina MiSeq metabarcoding of amplicons from the exact same COI region. This is the data for from the Oxford Nanopore run.

Scope
Thema's:
Biologie > Benthos > Macrobenthos, Biologie > Ecologie - biodiversiteit
Kernwoorden:
Marien/Kust, , DNA, Metabarcoding, Metagenomica, ANE, België

Geografische spreiding
ANE, België [Marine Regions]

Spreiding in de tijd
Oktober 2017

Parameters
Aantallen (geteld)
Soorten
Species richness

Bijdrage door
Wageningen University and Research Centre; Marine Animal Ecology, meerdata creator
Nord University; Faculty of Biosciences and Aquaculture, meerdata creator
Naturalis Biodiversity Center (NBC), meerdata creator
Instituut voor Landbouw-, Visserij- en Voedingsonderzoek (ILVO), meerdata creator

Gerelateerde datasets
Andere relaties:
Illumina MiSeq dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics, meer
Illumina Novaseq dataset for molecular macrobenthos biodiversity monitoring comparing Oxford Nanopore and Illumina based metabarcoding and metagenomics, meer

Dataset status: Afgelopen
Data type: Data
Data oorsprong: Onderzoek: labo-experiment
Metadatarecord aangemaakt: 2024-09-26
Informatie laatst gewijzigd: 2024-09-26
Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid