Op basis van de onderlinge afhankelijkheid is een zekere prioriteit aan de graadmeters gegeven. Graadmeters die primair de biologische randvoorwaarden bepalen (fysisch-chemische kenmerken, ecotopen) hebben daarbij de hoogste prioriteit gekregen, graadmeters met betrekking tot het functioneren van het Schelde-estuarium en de aanwezige ecotopen een lagere prioriteit waarbij de inschaling afhankelijk gesteld is van de plaats in de voedselketen en de invloed van externe factoren. Het is echter niet zo dat de ecologische toestand enkel op basis van de graadmeters met hoogste prioriteit goed beschreven kan worden.