KU Leuven; Rega-instituut; Department of Microbiology and Immunology; Bioinformatics and (eco-)systems biology lab, more
Function: Post-doctoral scientist
Direct contact at institute:
Tel.: +32-(0)16-37 22 22
E-mail: 
| |
| A1 Publications (7) [show] |
 Meng, L.; Delmont, T.O.; Gaia, M.; Pelletier, E.; Fernàndez-Guerra, A.; Chaffron, S.; Neches, R.Y.; Wu, J.; Kaneko, H.; Endo, H.; Ogata, H. (2023). Genomic adaptation of giant viruses in polar oceans. Nature Comm. 14(1): 6233. https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-41910-6, more- Rubbens, P.; Brodie, S.; Cordier, T.; Barcellos, D.D.; Devos, P.; Fernandes-Salvador, J.A.; Fincham, J.I.; Gomes, A.; Handegard, N.O.; Howell, K.; Jamet, C.; Kartveit, K.H.; Moustahfid, H.; Parcerisas, C.; Politikos, D.; Sauzède, R.; Sokolova, M.; Uusitalo, L.; Van den Bulcke, L.; van Helmond, A.T.M.; Watson, J.T.; Welch, H.; Beltran-Perez, O.; Chaffron, S.; Greenberg, D.S.; Kühn, B.; Kiko, R.; Lo, M.; Lopes, R.M.; Möller, K.O.; Michaels, W.; Pala, A.; Romagnan, J.-B.; Schuchert, P.; Seydi, V.; Villasante, S.; Malde, K.; Irisson, J.-O. (2023). Machine learning in marine ecology: An overview of techniques and applications. ICES J. Mar. Sci./J. Cons. int. Explor. Mer 80(7): 1829-1853. https://dx.doi.org/10.1093/icesjms/fsad100, more
- Guidi, L.; Chaffron, S.; Bittner, L.; Eveillard, D.; Larhlimi, A.; Roux, S.; Darzi, Y.; Audic, S.; Berline, L.; Brum, J.R.; Coelho, L.P.; Ignacio-Espinoza, J.C.; Malviya, S.; Sunagawa, S.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Poulain, J.; Searson, S.; Tara Oceans Consortium Coordinators; Stemmann, L.; Not, F.; Hingamp, P.; Speich, S.; Follows, M.; Karp-Boss, L.; Boss, E.S.; Ogata, H.; Pesant, S.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Acinas, S.G.; Bork, P.; de Vargas, C.; Iudicone, D.; Sullivan, M.B.; Raes, J.; Karsenti, E.; Bowler, C.; Gorsky, G. (2016). Plankton networks driving carbon export in the oligotrophic ocean. Nature (Lond.) 532(7600): 465-470. https://hdl.handle.net/10.1038/nature16942, more
- Brum, J.R.; Ignacio-Espinoza, J.C.; Roux, S.; Doulcier, G.; Acinas, S.G.; Alberti, A.; Chaffron, S.; Cruaud, C.; de Vargas, C.; Gasol, J.M.; Gorsky, G.; Gregory, A.C.; Guidi, L.; Hingamp, P.; Iudicone, D.; Not, F.; Ogata, H.; Pesant, S.; Poulos, B.T.; Schwenck, S.M.; Speich, S.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Searson, S.; Bork, P.; Bowler, C.; Sunagawa, S.; Wincker, P.; Karsenti, E.; Sullivan, M.B. (2015). Patterns and ecological drivers of ocean viral communities. Science (Wash.) 348(6237): 10 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1261498, more
- de Vargas, C.; Audic, S.; Henry, N.; Decelle, J.; Mahé, F.; Logares, R.; Lara, E.; Berney, C.; Le Bescot, N.; Probert, I.; Carmichael, M.; Poulain, J.; Romac, S.; Colin, S.; Aury, J.-M.; Bittner, L.; Chaffron, S.; Dunthorn, M.; Engelen, S.; Flegontova, O.; Guidi, L.; Horák, A.; Jaillon, O.; Lima-Mendez, G.; Lukeš, J.; Malviya, S.; Morard, R.; Mulot, M.; Scalco, E.; Siano, R.; Vincent, F.; Zingone, A.; Dimier, C.; Picheral, M.; Searson, S.; Kandels-Lewis, S.; Acinas, S.G.; Bork, P.; Bowler, C.; Gorsky, G.; Grimsley, N.; Hingamp, P.; Iudicone, D.; Not, F.; Ogata, H.; Pesant, S.; Raes, J.; Sieracki, M.E.; Speich, S.; Stemmann, L.; Sunagawa, S.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Karsenti, E. (2015). Eukaryotic plankton diversity in the sunlit ocean. Science (Wash.) 348(6237): 11 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1261605, more
- Lima-Mendez, G.; Faust, K.; Henry, N.; Decelle, J.; Colin, S.; Carcillo, F.; Chaffron, S.; Ignacio-Espinoza, J.C.; Roux, S.; Vincent, F.; Bittner, L.; Darzi, Y.; Wang, J.; Audic, S.; Berline, L.; Bontempi, G.; Cabello, A.M.; Coppola, L.; Cornejo-Castillo, F.M.; De Meester, L.; Ferrera, I.; Garet-Delmas, M.-J.; Guidi, L.; Lara, E.; Pesant, S.; Royo-Llonch, M.; Salazar, G.; Sánchez, P.; Sebastian, M.; Souffreau, C.; Dimier, C.; Picheral, M.; Searson, S.; Kandels-Lewis, S.; Gorsky, G.; Not, F.; Ogata, H.; Speich, S.; Stemmann, L.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Acinas, S.G.; Sunagawa, S.; Bork, P.; Sullivan, M.B.; Karsenti, E.; Bowler, C.; de Vargas, C.; Raes, J. (2015). Determinants of community structure in the global plankton interactome. Science (Wash.) 348(6237): 9 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1262073, more
- Sunagawa, S.; Coelho, L.P.; Chaffron, S.; Kultima, J.R.; Labadie, K.; Salazar, G.; Djahanschiri, B.; Zeller, G.; Mende, D.R.; Alberti, A.; Cornejo-Castillo, F.M.; Costea, P.I.; Cruaud, C.; d'Ovidio, F.; Engelen, S.; Ferrera, I.; Gasol, J.M.; Guidi, L.; Hildebrand, F.; Kokoszka, F.; Lepoivre, C.; Lima-Mendez, G.; Poulain, J.; Poulos, B.T.; Royo-Llonch, M.; Sarmento, H.; Vieira-Silva, S.; Dimier, C.; Picheral, M.; Searson, S.; Kandels-Lewis, S.; Bowler, C.; de Vargas, C.; Gorsky, G.; Grimsley, N.; Hingamp, P.; Iudicone, D.; Jaillon, O.; Not, F.; Ogata, H.; Pesant, S.; Speich, S.; Stemmann, L.; Suillivan, M.B.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Karsenti, E.; Raes, J.; Acinas, S.G.; Bork, P. (2015). Structure and function of the global ocean microbiome. Science (Wash.) 348(6237): 9 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1261359, more
|
| Report [show] |
- Vogt, M.; Sarmento, H.; Benedetti, F.; Huber, P.; Arboleda-Baena, C.; Bader, R.R.; Eriksson, D.; Knecht, N.; Chénier, N.; Jaillon, O.; Frémont, P.; Lombard, F.; Guidi, L.; Ricour, F.; van Sebille, E.; Schmiz, S.; Manral, D.; Clerc, C.; Santos, G.; Maiorano, L.; de Angelis, D.; Chaffron, S.; Eveillard, D.; Amaral-Zettler, L.; Gehlen, M.; Benard, G.; Frölicher, T. (2023). AtlantECO Deliverable 2.1: AtlantECO-BASE. Version 1. Zenodo: [s.l.]. 21 + appendix pp. https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.7944433, more
|
|
